Вариант с установкой GRUB в первый сектор раздела с Linux и загрузка NT-loader'ом (загрузчиком от Windows):После установки/переустановки Windows затирает MBR (Master Boot Record - главная загрузочная запись на жестком диске) без всяких вопросов, и ставит туда свой загрузчик NT-loader
Если вы хотите восстановить загрузку Linux, то надо выполнить пару нехитрых действий:
1) Загрузиться с Live-CD/DVD, поддерживающего GRUB
2) Установить загрузчик в первый сектор раздела с Linux, для этого в консоли проделываем следущее:  
 - запускаем  
 - ищем раздел,нам должно выдать примерно следущее
      (hd0,2) - (0) означает что раздел находиться на primary master и (2) он третий по счету (нумерация начинаеться с 0)  
 - делаем его корневым  
 - устанавливаем в него загрузчик
3) Поздравляю, загрузчик мы установили, а как же теперь все это дело подсунуть венде?! Опять идем во всеми любимую консоль и выполняем по следущей схеме ( нам надо сохранить загрузчик в файл, чтобы подсунуть NT-loader'у)
   # dd if=/dev/ваш_раздел_с_Linux of=/куда_копировать bs=512 count=1  (bs=512 означает что надо взять первые 512 байт, именно столько занимает загрузчик)
   Например:  
#dd if=/dev/sda3 of=/media/disk/loader.lnx bs=512 count=1
   (так я копирую загрузчик на флешку, смонтированную в каталог /media/disk)
4) теперь загружаемся в Windows и копируем файл например на диск c:\
    находим в корне диска файл boot.ini и  пишем в секции [operating systems] слудущее    
c:\loader.lnx="Написанное будет отображаться в NT-loader"
    в секции [boot loader] нужно поставить тайм-аут (в секундах) по истечении которого будет загружена ось которая стоит по умолчанию
   Пример boot.ini:
   [boot loader]
   timeout=10
   default=c:\loader.lnx
   [operating systems]
   c:\loader.lnx="-=Fedora Linux 8=-"
   multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Windows XP" /noexecute=optin /fastdetect
Загрузка linux после установки Vista реализуеться немного по другому, до пункта 3 выполняеться то же самое, этот вариант будет разобран посже  
Дополнения и поправки приветсвуються