mkfs.vfat /dev/sdb1 ессно девайс надо выбрать свой. Что значит безопасно? Что не взорвется 100%
Я что-то слышал, что у флешек есть что-то вроде superblock, после форматирования которого флешка перестает читаться (и что mkfs.vfat его именно и форматирует)