Под вайном прекрасно работает читалка cr3. Она кстати под виндой не требует установки, может поэтому и работает нормально. А кстати в какой каталог распаковывать PyBookReader и где там исполняемый файл. Очередная попытка провернуть стандартные ./configure (нет такого файла), make (всё сработало) и наконец make install (нет цели) ни к чему не привели, как не было читалки, так и нет. Обидно, в ALTLinux она по умолчанию грузится.
Читай ридми, там ничего устанавливать не надо. исполняемый файл - питоновский