Сообщение #5383

[Леголегс]

Наверно, проблема в переменных окружения. Попробуй выполнить из консоли set > set.tty.txt, а по альт+эф2 sh -c "set > set.X.txt" и восмотри различия через diff set.tty.txt set.X.txt
Возможно найдёшь причину.
А может всё дело в банальной стартовой директории, для альтэф2 она всегда ~/ для значков тоже, если прямо не указана, а для консоли соответственно в какую перейдёшь.
PS смотреть различия веселее через kdiff3, если установлен.