Если Wine стояит в системе ... то просто открываешь консоль и пишешь, ну например:
wine /full/path/to/flylink.exe
Т.е. указываешь вайну что запустить (в данном случае инсталятор). Устанавливаешь как и в винде тупо нажимая ДАЛЕЕ
... Установка закончена.
Для того чтобы запустить установленный Flylink (на примере моего компа)
wine "/home/desperate/.wine/drive_c/Program Files/FlylinkDC++/FlyLinkDC.exe"
Ну если повезет, то запустится...
Ну у меня еще это можно сделать проще (среда Gnome, мож в KDE че на подобие есть я ХЗ):
Приложения->Wine->Программы->FlyLinkDC++->FlyLinkDC++и понеслась ...
Будут вопросы спрашивай...