Все-таки хотелось бы LINUX, т.к. с FreeBSD мало опыта общения (собственно сабж). В первую очередь интересует быстрая дисковая подсистема - SCSI или RAID, т.к. ожидается активная работа пользователей с файлами на сервере.
Я так понимаю интересует какой контроллер взять, чтобы не было гемороя? Гигабитную сеть делать собрались? Если нет, то SATA будет за уши (да и ATA хватит), рейд(а тем более SCSI) тут не нужен ИМХО.