Запускал STALKER 1.0006 под Ubuntu 8.04.1 c WINE 1.0.1 (видео-карта GeForce 9600GT 512). В настройках не удалось включить динамическое освещение/полное динамическое освещение (по всей видимости не поддерживает текущая версия WINE).
А вот настройки самого WINE для запуска брал с её родной базы данных о совместимости приложений
www.winehq.org - там кликаем по WINE DB и ищем STALKER/STALKER Clear Sky.