1. одна учетка для учеников + скрипт, восстанавливающий настройки (rm -f ~/* например
)
Главное - это побудит детей изучать много литературы и искать - как, млин, это сломать? Чтоб быть круче, чем тот, кто ставил и настраивал все. А это и есть - учебный процесс!