Может ядро стоит нестандартное? Или симлинка в /usr/lib/modules/2.6.24.4-desktop-3mnb/build/include/ нет?
В /usr/lib/modules/ находятся папки 2.6.24.4-desktop-1mnb и 2.6.24.4-desktop-3mnb, в первой есть симлинк а во второй нету даже паки build. Коряво встало может быть.
Решил переустановить kernel-desktop-2.6.24.4-3mnb, удалил а установить не могу - нету его уже в репозитарии...